Институт ботаники физиологии, и генетики растений Национальной академии наук Таджикистана создан Постановлением Правительства Республики Таджикистан №32 от 4 февраля 2011 года (как правопреемник) на базе объединения Института ботаники АН РТ и Института физиологии растений и генетики АН РТ.
Директором института является кандидат биологических наук Бобозода Бакоходжа (2019 — по настоящее время).
Институт входит в состав Отделения биологических и медицинских наук Национальной академии наук Таджикистана .
В настоящее время в институте работают 57 научных сотрудников, 12 докто-ров наук (в том числе 1 академик НАНТ, 4 члена-корреспондента НАНТ), 22 кандидата наук.
Институт ботаники АН РТ в разные годы возглавляли академик, Герой Социалистического Труда П.Н.Овчинников (1941-1977 гг.), чл.-корр. М.Р. Расулова (1977-1987 гг.), академик А.Н. Максумов (1987-1992 гг.), чл.-корр. М.И. Исмаилов (1992-1996 гг.), к.б.н. А.А. Мадаминов (и.о. 1996-1998 гг.) и чл.-корр. Х.Х.Хисориев (1998-2011 гг.).
Директорами Института физиологии растений и генетики АН РТ были академики Ю.С.Насыров (1964-1986 гг.) и Х.Х.Каримов (1987-2011 гг.).
Основными направлениями научных исследований института являются:
- изучение систематического состава флоры высших и низших растений, ботаническое ресурсоведение, геоботанические исследования, картирование растительности Таджикистана
- разработка теоретических основ и методов использования достижений физиологии и биохимии растений, генетики и молекулярной биологии для повышения эффективности фотосинтеза
- создания высокоурожайных, устойчивых к действию неблагоприятных факторов сортов сельскохозяйственных культур и совершенствование технологий их возделывания
- применение биотехнологических приемов в растениеводстве, экологическая физиология и биохимия растений